Universe系列，简称U系列，U版。原身为BotCon迷友漫画，将之前众多系列人物时空交错的混在一起的漫画，不少原形被重新配色定义为新的角色。后被孩之宝收为官方系列，在2005年又转为商店专售和孩之宝自属网上商店专售，将不少BW/BM/RID甚至是新系列的人物重涂推出。只有漫画，没有动画。说到U版，原来E版的恐龙合体是作为U版的第一套原创设计，后考虑到E版热销，故把恐龙也加入到E版中推出。（不同于真人电影版的U版）。
